domingo, 15 de junio de 2025

Técnica de hibridación y amplificación basada en secuencia para Covid 19 (SARS-CoV-2)

 Técnica: RT-PCR (Reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa)

Diagnóstico molecular está basado en la conversión del ARN viral en ADNc y su posterior amplificación usando sondas específicas (hibridación y amplificación basada en secuencia). Se utilizan genes diana como N, E, RdRp y ORF1ab para asegurar alta sensibilidad y especificidad. Esta técnica permite detectar bajas cargas virales. Las mutaciones del virus pueden afectar la eficacia de las sondas, lo que requiere actualizaciones continuas. Se usan alternativas como RT-LAMP y PCR digital


Imagen obtenida de: 
http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1794-24702020000300011

Referencias Bibliográficas

  1. Dhar. Diagnostic assay and technology advancement for detecting SARS-COV-2 infections causing the COVID-19 pandemic. PubMed Central [Internet]. 2022;414(9):2903-34. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8872642/
  2. López BOP, Orozco BR, León JJC. SARS-CoV-2: generalidades bioquímicas y métodos de diagnóstico. Nova [Internet]. 25 de septiembre de 2020;18(35):11-33. Disponible en: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1794-24702020000300011


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sábado, 7 de junio de 2025

Prueba PCR para Hepatitis B

El estudio se basó en el kit SUMASIGNAL VHB, se utilizó muestras de suero (positivas, negativas y controles de coinfección). Para la extracción del AN, se usó Proteinasa K (PCR cualitativa) y columnas QIAamp (PCR en tiempo real). Se empleó PCR cualitativa para la región preC/C y PCR en tiempo real (RCP‑TR con sonda TaqMan) dirigida al gen C. Los resultados fueron cualitativos (detección de VHB) y cuantitativos (carga viral con rango hasta 10⁸ UI/mL, límite de detección 16,41 UI/µL). El sistema SUMASIGNAL VHB demostró alta sensibilidad, especificidad, buena reproducibilidad y correlación con un kit comercial.

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=Kyo1XlCIPFo

Referencias Bibliográficas

1.      Rodriguez Lay. Evaluación de una reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real simple y rápida para la cuantificación del ADN del virus de la hepatitis B. Revista Cubana de Medicina Tropical [Internet]. agosto de 2020;72(2). Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_abstract&pid=S0375-07602020000200005&lng=es&nrm=iso&tlng=es

2.      HiMedia Laboratories Pvt Ltd. MBPCR181 - HiPCR® Hepatitis B Virus (HBV) Detection and Quantitation Probe PCR Kit. [Internet]. YouTube. 2025. Disponible en: https://www.youtube.com/watch?v=Kyo1XlCIPFo


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domingo, 1 de junio de 2025

Técnica de secuenciación para la fibrosis quistica


Se aplicó la técnica de secuenciación de próxima generación (NGS) para el cribado del gen CFTR, utilizando el kit Devyser CFTR NGS y el sistema Illumina MiSeq. Se detectó al menos un alelo alternativo en el 23 % de los sujetos y una frecuencia de portadores patogénicos de 1:12. La variante más común, p.(Phe508del), se encontró en el 37 % de los individuos mutados. Se identificaron tres nuevas variantes con posible efecto perjudicial mediante análisis bioinformático. La NGS demostró ser eficaz para detectar portadores asintomáticos y variabilidad genética del CFTR.

1.   De Paolis E, Tilocca B, Lombardi C, De Bonis M, Concolino P, Onori ME, et al. Next-Generation Sequencing for Screening Analysis of Cystic Fibrosis: Spectrum and Novel Variants in a South–Central Italian Cohort. Genes [Internet]. 11 de agosto de 2023;14(8):1608. Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37628659/

2.  Tópicos Nucleicos. Método Illumina de secuenciación masiva de DNA [Internet]. YouTube. 2021. Disponible en: https://www.youtube.com/watch?v=JuYVko-a1Qg

3. Fibrosis quística - Síntomas y causas - Mayo Clinic [Internet]. 2025. Disponible en: https://www.mayoclinic.org/es/diseases-conditions/cystic-fibrosis/symptoms-causes/syc-20353700#dialogId5641335



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